實驗室設施開展無菌檢查及微生物限度檢查工作，首先要按照《藥品檢驗所實驗室質量管理規范》及《藥品生產質量管理規范》的要求，建立一個布局合理、使用方便、操作安全的無菌室，并且配有完善的實驗設施和管理制度。無菌檢查、微生物限度檢查以及接種室（接種對照菌、菌種傳代）均應嚴格分開，具有危險性的毒株、毒素如破傷風梭菌、黃曲霉毒素的實驗室需單獨使用，以便控制防止傳播。
（一）潔凈實驗室
1、潔凈實驗室布局
a、根據樣品檢驗要求，一般應至少包括更衣緩沖系統、微生物限度檢查室、無菌檢查室、陽性菌室和物流通道。
b、更衣系統應至少包括一更（含更鞋）、二更（含洗手）、緩沖以及人流走廊等。
c、物流通道應考慮凈污分流的布局，有條件的可設置污物走廊。
2、潔凈室的設計要求
a、凈化級別：潔凈走廊、檢查室、陽性菌室應為一萬級，其他房間應為十萬級。
b、氣流組織：陽性菌室對走廊呈負壓，走廊對緩沖有5Pa的正壓，陽性菌室全排風。
c、電氣控制：控制開關外置，設置通訊系統。
3、結構與要求
無菌潔凈室不宜設在底層，防潮、防霉、采光好，遠離交通干道，廁所及污染區，面積不超過10m2，高度不超過2.4m，由兩個緩沖間、操作間組成。操作間緩沖間之間應有樣品傳遞窗，出入操作間和緩沖間的門不應直對。無菌室內應六面光滑平整，無縫隙，不起灰，不落塵，耐腐蝕，易清洗，墻壁與地面、墻壁與天花板連接處應呈凹弧形，操作間不得安裝下水道。
無菌室內的照明燈應嵌裝在天花板內，采光面積要大，光照應分布均勻，光照度不低于300勒克斯。緩沖間和操作間應裝有紫外線殺菌燈（2－25w/m3）用于空氣消毒。紫外線波長200－300nm者具有殺菌作用，其中以265－266nm殺菌作用最強，這與DNA的吸收光譜范圍一致，其殺菌機理可能是在細菌細胞DNA中引起胸腺嘧啶雙聚體形成，從而干擾細菌細胞DNA復制，導致細菌變異死亡。紫外線殺菌燈1m以內距離殺菌效果最佳，每次開燈照射時間為30min。應定期檢查紫外線燈輻射強度，不得低于70μW?cm-21m距離。其缺點是穿透力弱，一張紙板可以阻礙光的透過，不能穿透固體物，故只能用作表面消毒及一些不耐熱或化學消毒劑物品的消毒。
4、溫度、濕度
無菌室內溫度和相對濕度直接影響紫外殺菌燈的殺菌效果，故溫度最好控制在25±2℃，相對濕度40－60％。操作間或凈化工作臺的潔凈空氣應保持對環境形成正壓，不低于49Pa。
5、操作間
無菌室內應安裝空氣除菌過濾層流裝置及調溫裝置。潔凈度要求：凈化工作臺潔凈度為100級，無菌室應為10000級。
操作間應準備乙醇燈（或煤氣燈），火柴，2％碘酊棉球及75％乙醇棉球、試管架、大小橡皮乳頭、砂輪、記號筆、無菌剪刀、鑷子、注射器等。微生物限度檢查無菌室操作間內還應有電子稱（感覺為0.1g，最大稱量為300g為宜），電動勻漿儀等。
6、緩沖間
緩沖間內應有洗手盆，消毒液，無菌衣，帽，口罩，拖鞋等，緩沖間內不應放置培養箱和其他雜物。
（二）潔凈室的使用
1.在實驗開始之前1小時啟動風機系統（空調系統），并開啟空氣消毒裝置，消毒至少半小時后關閉。
2.觀察并確保潔凈室的壓差。
3.物品經物流通道進入潔凈室。
4.人員正確著裝后經人流通道進入潔凈室。
5.使用完畢，應用消毒液清潔工作臺面，驗人員在更衣室換下無菌工作衣后出潔凈工作室，開啟空氣消毒裝置，消毒至少半小時后，關閉潔凈工作室的控制開關。
（三）潔凈室的清潔維護
1.潔凈室的清潔維護分為日常維護、定期維護和不符合時的維護。
2.日常維護由每次實驗的實驗人員進行，維護的范圍為進行實驗的潔凈工作室和輔助潔凈區，維護的頻率為每次實驗后。
3.定期維護由實驗室指定專人進行，維護的范圍為所有潔凈工作室，維護的頻率為每二周一次。
